407 papers
De evolutiebiologie verkent hoe leven op aarde zich door de tijd heen heeft ontwikkeld en aangepast. Deze fascinerende wetenschap bestudeert de mechanismen achter diversiteit, variatie en de aanpassing van soorten aan hun omgeving. Van de kleinste genetische veranderingen tot de vorming van nieuwe soorten, dit veld biedt een diep inzicht in de geschiedenis van het leven zelf.
Op Gist.Science verzamelen we elk nieuw voorpublicatieartikel dat op bioRxiv verschijnt binnen dit domein. Voor elke preprint bieden we zowel een toegankelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat iedereen de nieuwste inzichten kan begrijpen zonder vast te lopen in jargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties over evolutiebiologie.
Deze studie toont aan dat proteïnelinguïstische modellen structurele fitness verwarren met mutatieaanbodbiases, waarbij wordt onthuld dat het expliciet ontkoppelen van deze factoren de voorspelling van opkomende virale varianten verbetert, terwijl het bevestigt dat selectie de frequentie van gevestigde varianten domineert.
Heranalyse van transcriptomen van hitte-geëvolueerde stammen van de koraalsymbioot *Cladocopium proliferum* onthult dat divergente exon-gebruik en alternatieve splicingpatronen, in plaats van veranderingen in de algehele genexpressie, stammen met variërende thermische en bleektolerantie onderscheiden, wat de noodzaak van fijnmazige splicinganalyses benadrukt om adaptieve mechanismen te begrijpen.
RegEvol is een nieuw raamwerk dat directionele selectie in regulatoir DNA detecteert door machine learning-gebaseerde voorspellingen van transcriptiefactorbinding te integreren met expliciete evolutionaire modellen om fitnessfuncties af te leiden, waarmee het succesvol adaptieve signalen in zowel *Drosophila*- als menselijke genomen heeft geïdentificeerd.
Door een combinatie van ruimtelijke modellering en fylogenetische analyse van meer dan 11.000 bacteriële genomen onthult deze studie dat flagellaire motiliteit is geëvolueerd in een sterke, afhankelijke associatie met contactafhankelijke Type VI-secretiesystemen om competitieve ontmoetingen te verbeteren, terwijl het geen dergelijke koppeling vertoont met diffuse bacteriocines.
Hoewel temperatuur de meest dramatische plastische veranderingen in de ontwikkelingstijd van *Drosophila melanogaster* induceert, is nutritionele stress de primaire drijfveer die de richting van selectie en evolutionair potentieel vormgeeft, wat aantoont dat de omgevingsfactor die de grootste plastische respons veroorzaakt niet noodzakelijkerwijs de selectie en evolutie van het kenmerk dicteert.
Dit artikel stelt een nieuwe kwantiseringstheoretische methode voor voor het discretiseren van Gamma-snelheidsverdelingen in fylogenetische inferentie, die de inherente bias in taklengte in het standaard discrete Gamma-model aanzienlijk vermindert, met name voor grote bomen met korte takken.
Deze studie toont aan dat hoewel bestaande tip-rate methoden toekomstige diversificatie in tetrapode lineages kunnen voorspellen met behulp van fossiele en huidige fylogenieën, hun voorspellend succes matig is en significant varieert afhankelijk van het specifieke model en de gebruikte gegevensbron.
Deze studie identificeert een nieuw, geografisch wijdverspreid lineage van *Chilomastix mesnili* in wilde Marokkaanse Barbarijapen in die afwijkt van de gebruikelijke menselijke stam en nauw verwant is aan isolaten van varkens en Japanse makaken, gebaseerd op de analyse van metagenomische 18S rRNA-sequenties en de reconstructie van een compleet rDNA-operon.
Door adaptieve aminozuurveranderingen over 14 soorten te analyseren, toont deze studie aan dat taxon-specifieke mutatiebiases de patronen van moleculaire adaptatie sterk vormgeven, waarbij mutatietypes die vaker voorkomen disproportioneel bijdragen aan adaptieve substituties.
Dit artikel presenteert een kwantitatief model dat geometrisch nauwkeurige prooi-vangstsimulaties integreert met energetische kostenbeoordelingen om de groeisnelheden van heliozoën te voorspellen, wat een breed toepasbaar kader biedt voor het begrijpen van de evolutionaire fitness van diverse voedingsmechanismen van enkelcelige eukaryoten.